MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfurospirillum barnesii SES-3 chromosome

Total Repeats: 52593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018002	T	6	6	33	38	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018002	TGTT	2	8	47	54	0 %	75 %	25 %	0 %	390939175
3	NC_018002	AGA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939175
4	NC_018002	TCT	2	6	92	97	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390939175
5	NC_018002	AAC	2	6	120	125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390939175
6	NC_018002	A	6	6	254	259	100 %	0 %	0 %	0 %	390939175
7	NC_018002	ATT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939175
8	NC_018002	A	6	6	352	357	100 %	0 %	0 %	0 %	390939175
9	NC_018002	TCCT	2	8	370	377	0 %	50 %	0 %	50 %	390939175
10	NC_018002	TGT	2	6	394	399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390939175
11	NC_018002	TTTA	2	8	476	483	25 %	75 %	0 %	0 %	390939175
12	NC_018002	AC	3	6	506	511	50 %	0 %	0 %	50 %	390939175
13	NC_018002	TCAT	2	8	513	520	25 %	50 %	0 %	25 %	390939175
14	NC_018002	CAAAG	2	10	539	548	60 %	0 %	20 %	20 %	390939175
15	NC_018002	TTAT	2	8	558	565	25 %	75 %	0 %	0 %	390939175
16	NC_018002	CCA	2	6	567	572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390939175
17	NC_018002	CAAT	2	8	610	617	50 %	25 %	0 %	25 %	390939175
18	NC_018002	TGA	2	6	667	672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939175
19	NC_018002	AAG	2	6	705	710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939175
20	NC_018002	T	6	6	713	718	0 %	100 %	0 %	0 %	390939175
21	NC_018002	AGA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939175
22	NC_018002	GATT	2	8	831	838	25 %	50 %	25 %	0 %	390939175
23	NC_018002	ATT	2	6	878	883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939175
24	NC_018002	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939175
25	NC_018002	ATA	2	6	957	962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390939175
26	NC_018002	TAT	2	6	982	987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939175
27	NC_018002	ATGCCT	2	12	996	1007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390939175
28	NC_018002	ATT	2	6	1100	1105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939175
29	NC_018002	CCA	2	6	1152	1157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390939175
30	NC_018002	TTG	2	6	1173	1178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390939175
31	NC_018002	TATT	2	8	1195	1202	25 %	75 %	0 %	0 %	390939175
32	NC_018002	CTT	2	6	1233	1238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390939175
33	NC_018002	ATA	2	6	1281	1286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390939175
34	NC_018002	A	7	7	1289	1295	100 %	0 %	0 %	0 %	390939175
35	NC_018002	AGA	2	6	1339	1344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939175
36	NC_018002	A	6	6	1348	1353	100 %	0 %	0 %	0 %	390939175
37	NC_018002	A	6	6	1390	1395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018002	A	6	6	1410	1415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018002	T	7	7	1424	1430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018002	CTA	2	6	1490	1495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018002	TTAA	2	8	1508	1515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018002	A	8	8	1549	1556	100 %	0 %	0 %	0 %	390939176
43	NC_018002	TTA	2	6	1574	1579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939176
44	NC_018002	A	8	8	1599	1606	100 %	0 %	0 %	0 %	390939176
45	NC_018002	AGA	2	6	1645	1650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939176
46	NC_018002	TACC	2	8	1693	1700	25 %	25 %	0 %	50 %	390939176
47	NC_018002	A	6	6	1751	1756	100 %	0 %	0 %	0 %	390939176
48	NC_018002	GAT	2	6	1784	1789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939176
49	NC_018002	ATT	2	6	1793	1798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939176
50	NC_018002	AAACA	2	10	1829	1838	80 %	0 %	0 %	20 %	390939176
51	NC_018002	ACA	2	6	1928	1933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390939176
52	NC_018002	A	7	7	1949	1955	100 %	0 %	0 %	0 %	390939176
53	NC_018002	AAT	2	6	1976	1981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390939176
54	NC_018002	CAA	2	6	2078	2083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390939176
55	NC_018002	AAT	2	6	2093	2098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390939176
56	NC_018002	TAT	2	6	2107	2112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939176
57	NC_018002	A	6	6	2117	2122	100 %	0 %	0 %	0 %	390939176
58	NC_018002	T	6	6	2147	2152	0 %	100 %	0 %	0 %	390939176
59	NC_018002	GAT	2	6	2153	2158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939176
60	NC_018002	ACT	2	6	2185	2190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390939176
61	NC_018002	TTA	2	6	2226	2231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939176
62	NC_018002	TAT	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939176
63	NC_018002	A	6	6	2266	2271	100 %	0 %	0 %	0 %	390939176
64	NC_018002	CAAA	2	8	2320	2327	75 %	0 %	0 %	25 %	390939176
65	NC_018002	TC	3	6	2337	2342	0 %	50 %	0 %	50 %	390939176
66	NC_018002	A	6	6	2370	2375	100 %	0 %	0 %	0 %	390939176
67	NC_018002	ATG	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939176
68	NC_018002	AGAT	2	8	2421	2428	50 %	25 %	25 %	0 %	390939176
69	NC_018002	T	6	6	2488	2493	0 %	100 %	0 %	0 %	390939176
70	NC_018002	AG	3	6	2557	2562	50 %	0 %	50 %	0 %	390939176
71	NC_018002	TAT	3	9	2578	2586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939176
72	NC_018002	TAT	2	6	2590	2595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939176
73	NC_018002	GTAT	2	8	2690	2697	25 %	50 %	25 %	0 %	390939177
74	NC_018002	TGA	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939177
75	NC_018002	TAA	2	6	2789	2794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390939177
76	NC_018002	ACTC	2	8	2802	2809	25 %	25 %	0 %	50 %	390939177
77	NC_018002	CAG	2	6	2882	2887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390939177
78	NC_018002	GTT	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390939177
79	NC_018002	GGT	2	6	2953	2958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390939177
80	NC_018002	TTC	2	6	2994	2999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390939177
81	NC_018002	AAC	2	6	3090	3095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390939177
82	NC_018002	AAC	2	6	3108	3113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390939177
83	NC_018002	GGT	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390939177
84	NC_018002	TAA	2	6	3300	3305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390939177
85	NC_018002	A	6	6	3304	3309	100 %	0 %	0 %	0 %	390939177
86	NC_018002	ATG	2	6	3373	3378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939177
87	NC_018002	T	6	6	3401	3406	0 %	100 %	0 %	0 %	390939177
88	NC_018002	TGG	2	6	3438	3443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390939177
89	NC_018002	GAT	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939177
90	NC_018002	AAC	2	6	3671	3676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390939177
91	NC_018002	GAA	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939177
92	NC_018002	AAGCTA	2	12	3707	3718	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390939177
93	NC_018002	TGC	2	6	3735	3740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390939177
94	NC_018002	GCT	2	6	3757	3762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390939177
95	NC_018002	GCGG	2	8	3889	3896	0 %	0 %	75 %	25 %	390939177
96	NC_018002	A	6	6	3968	3973	100 %	0 %	0 %	0 %	390939177
97	NC_018002	GAA	2	6	4057	4062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939177
98	NC_018002	ATC	2	6	4084	4089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390939177
99	NC_018002	CTT	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390939177
100	NC_018002	CTT	2	6	4152	4157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390939177
101	NC_018002	TTTA	2	8	4184	4191	25 %	75 %	0 %	0 %	390939177
102	NC_018002	ACC	2	6	4197	4202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390939177
103	NC_018002	A	6	6	4216	4221	100 %	0 %	0 %	0 %	390939177
104	NC_018002	A	6	6	4225	4230	100 %	0 %	0 %	0 %	390939177
105	NC_018002	GAT	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939177
106	NC_018002	T	6	6	4266	4271	0 %	100 %	0 %	0 %	390939177
107	NC_018002	TTGA	2	8	4414	4421	25 %	50 %	25 %	0 %	390939177
108	NC_018002	ATT	2	6	4455	4460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939177
109	NC_018002	A	7	7	4483	4489	100 %	0 %	0 %	0 %	390939177
110	NC_018002	ATG	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939177
111	NC_018002	ATG	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939177
112	NC_018002	AGA	2	6	4563	4568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939177
113	NC_018002	CTT	2	6	4570	4575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390939177
114	NC_018002	GAA	2	6	4609	4614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939177
115	NC_018002	AG	4	8	4641	4648	50 %	0 %	50 %	0 %	390939177
116	NC_018002	GACG	2	8	4663	4670	25 %	0 %	50 %	25 %	390939177
117	NC_018002	A	6	6	4700	4705	100 %	0 %	0 %	0 %	390939177
118	NC_018002	A	6	6	4711	4716	100 %	0 %	0 %	0 %	390939177
119	NC_018002	TTG	2	6	4804	4809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390939177
120	NC_018002	GAT	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939177
121	NC_018002	GCT	2	6	4834	4839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390939177
122	NC_018002	A	6	6	4950	4955	100 %	0 %	0 %	0 %	390939178
123	NC_018002	GA	4	8	4956	4963	50 %	0 %	50 %	0 %	390939178
124	NC_018002	T	9	9	5020	5028	0 %	100 %	0 %	0 %	390939178
125	NC_018002	TATT	2	8	5080	5087	25 %	75 %	0 %	0 %	390939178
126	NC_018002	TGAT	2	8	5143	5150	25 %	50 %	25 %	0 %	390939178
127	NC_018002	TC	3	6	5183	5188	0 %	50 %	0 %	50 %	390939178
128	NC_018002	A	7	7	5195	5201	100 %	0 %	0 %	0 %	390939178
129	NC_018002	A	6	6	5204	5209	100 %	0 %	0 %	0 %	390939178
130	NC_018002	A	7	7	5211	5217	100 %	0 %	0 %	0 %	390939178
131	NC_018002	ATT	2	6	5223	5228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939178
132	NC_018002	T	7	7	5323	5329	0 %	100 %	0 %	0 %	390939178
133	NC_018002	GAA	2	6	5331	5336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939178
134	NC_018002	AC	3	6	5350	5355	50 %	0 %	0 %	50 %	390939178
135	NC_018002	GAA	2	6	5409	5414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939178
136	NC_018002	CAAA	2	8	5451	5458	75 %	0 %	0 %	25 %	390939178
137	NC_018002	ACA	2	6	5467	5472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390939178
138	NC_018002	TC	3	6	5483	5488	0 %	50 %	0 %	50 %	390939178
139	NC_018002	TCA	2	6	5493	5498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390939178
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141	NC_018002	CAAA	2	8	5568	5575	75 %	0 %	0 %	25 %	390939178
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148	NC_018002	CAA	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390939178
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270	NC_018002	CA	3	6	12126	12131	50 %	0 %	0 %	50 %	390939184
271	NC_018002	A	7	7	12143	12149	100 %	0 %	0 %	0 %	390939184
272	NC_018002	AGT	2	6	12287	12292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939185
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274	NC_018002	TTA	2	6	12372	12377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939185
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292	NC_018002	CAT	2	6	13335	13340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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407	NC_018002	AG	3	6	18272	18277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_018002	CT	3	6	18350	18355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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